--algorithm:m
--input-file:Z:/Mohsen/code/sim_4DSTEM/Mohsen_graphene_2_layers_4_7_tile.xyz
--output-file:Z:\Mohsen\code\sim_4DSTEM\bilayer_no_defects\conv_20mrad_100ADefocus\conv_20mrad_100Adef.h5
--num-threads:12
--pixel-size-x:0.2
--pixel-size-y:0.2
--potential-bound:2
--num-FP:8
--slice-thickness:1
--num-slices:0
--zstart-slices:0
--energy:80
--alpha-max:24
--batch-size-cpu:1
--probe-step-x:0.2
--probe-step-y:0.2
--cell-dimension:16.7663 16.94 3.395
--tile-uc:1 1 1
--probe-defocus:100
-C3:0
-C5:0
--probe-semiangle:20
--detector-angle-step:1
--probe-xtilt:0
--probe-ytilt:0
--scan-window-x:0 0.99999
--scan-window-y:0 0.99999
--scan-window-xr:0 0
--scan-window-yr:0 0
--random-seed:25212
--4D-amax:0.0001
--thermal-effects:1
--save-3D-output:0
--save-4D-output:1
--4D-crop:0
--save-DPC-CoM:1
--save-potential-slices:1
--save-real-space-coords:0
--occupancy:1
--nyquist-sampling:0
--also-do-cpu-work:1
--batch-size-gpu:1
--num-gpus:4
--num-streams:3